Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLI4P10075 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI4P10075 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI4P10075 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI4P10075 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI4P10075 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI4P10075 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI4P10075 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI4P10075 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI4P10075 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI4P10075 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI4P10075 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLI4P10075 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI4P10075 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI4P10075 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI4P10075 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI4P10075 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI4P10075 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI4P10075 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI4P10075 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI4P10075 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI4P10075 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI4P10075 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI4P10075 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI4P10075 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI4P10075 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI4P10075 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI4P10075 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI4P10075 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI4P10075 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI4P10075 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI4P10075 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI4P10075 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI4P10075 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI4P10075 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI4P10075 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI4P10075 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI4P10075 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI4P10075 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI4P10075 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI4P10075 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GLI4P10075 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI4P10075 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI4P10075 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI4P10075 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GLI4P10075 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLI4P10075 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLI4P10075 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLI4P10075 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GLI4P10075 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI4P10075 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI4P10075 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI4P10075 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI4P10075 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI4P10075 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GLI4P10075 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLI4P10075 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GLI4P10075 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GLI4P10075 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GLI4P10075 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI4P10075 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GLI4P10075 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLI4P10075 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLI4P10075 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLI4P10075 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLI4P10075 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GLI4P10075 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GLI4P10075 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI4P10075 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI4P10075 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI4P10075 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GLI4P10075 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI4P10075 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI4P10075 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI4P10075 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI4P10075 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI4P10075 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI4P10075 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI4P10075 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI4P10075 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI4P10075 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI4P10075 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI4P10075 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI4P10075 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI4P10075 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI4P10075 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI4P10075 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI4P10075 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI4P10075 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI4P10075 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI4P10075 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI4P10075 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI4P10075 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI4P10075 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI4P10075 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI4P10075 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI4P10075 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI4P10075 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI4P10075 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI4P10075 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms