Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRSS56P0CW18 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRSS56P0CW18 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRSS56P0CW18 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRSS56P0CW18 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRSS56P0CW18 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRSS56P0CW18 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRSS56P0CW18 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRSS56P0CW18 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRSS56P0CW18 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRSS56P0CW18 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRSS56P0CW18 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRSS56P0CW18 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRSS56P0CW18 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRSS56P0CW18 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRSS56P0CW18 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRSS56P0CW18 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRSS56P0CW18 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRSS56P0CW18 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRSS56P0CW18 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRSS56P0CW18 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRSS56P0CW18 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRSS56P0CW18 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRSS56P0CW18 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRSS56P0CW18 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRSS56P0CW18 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRSS56P0CW18 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms