Protein–RNA interactions for Protein: P0CI25

TRIM49, Tripartite motif-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49P0CI25 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM49P0CI25 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM49P0CI25 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM49P0CI25 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM49P0CI25 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM49P0CI25 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM49P0CI25 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM49P0CI25 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM49P0CI25 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM49P0CI25 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM49P0CI25 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM49P0CI25 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM49P0CI25 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM49P0CI25 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM49P0CI25 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM49P0CI25 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM49P0CI25 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM49P0CI25 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM49P0CI25 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM49P0CI25 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM49P0CI25 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM49P0CI25 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM49P0CI25 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM49P0CI25 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM49P0CI25 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM49P0CI25 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM49P0CI25 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM49P0CI25 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM49P0CI25 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM49P0CI25 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM49P0CI25 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM49P0CI25 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms