Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBBP0CG47 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBBP0CG47 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBBP0CG47 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBBP0CG47 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBBP0CG47 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBBP0CG47 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBBP0CG47 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBBP0CG47 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBBP0CG47 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBBP0CG47 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBBP0CG47 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBBP0CG47 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBBP0CG47 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBBP0CG47 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBBP0CG47 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBBP0CG47 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBBP0CG47 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBBP0CG47 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBBP0CG47 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBBP0CG47 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBBP0CG47 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBBP0CG47 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBBP0CG47 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBBP0CG47 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBBP0CG47 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms