Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFTA3P0C7M3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFTA3P0C7M3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFTA3P0C7M3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFTA3P0C7M3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFTA3P0C7M3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFTA3P0C7M3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFTA3P0C7M3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFTA3P0C7M3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFTA3P0C7M3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFTA3P0C7M3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFTA3P0C7M3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFTA3P0C7M3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFTA3P0C7M3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFTA3P0C7M3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFTA3P0C7M3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFTA3P0C7M3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFTA3P0C7M3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SFTA3P0C7M3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFTA3P0C7M3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFTA3P0C7M3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFTA3P0C7M3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFTA3P0C7M3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFTA3P0C7M3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFTA3P0C7M3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFTA3P0C7M3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFTA3P0C7M3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFTA3P0C7M3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFTA3P0C7M3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFTA3P0C7M3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFTA3P0C7M3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFTA3P0C7M3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFTA3P0C7M3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFTA3P0C7M3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFTA3P0C7M3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFTA3P0C7M3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFTA3P0C7M3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFTA3P0C7M3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFTA3P0C7M3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFTA3P0C7M3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFTA3P0C7M3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFTA3P0C7M3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms