Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRCP08575 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRCP08575 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRCP08575 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRCP08575 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRCP08575 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRCP08575 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRCP08575 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRCP08575 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRCP08575 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRCP08575 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRCP08575 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRCP08575 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRCP08575 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRCP08575 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRCP08575 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRCP08575 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRCP08575 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRCP08575 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRCP08575 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRCP08575 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PTPRCP08575 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRCP08575 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRCP08575 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRCP08575 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRCP08575 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRCP08575 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRCP08575 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PTPRCP08575 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRCP08575 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRCP08575 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRCP08575 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRCP08575 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRCP08575 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PTPRCP08575 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PTPRCP08575 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PTPRCP08575 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPRCP08575 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PTPRCP08575 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRCP08575 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRCP08575 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRCP08575 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PTPRCP08575 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRCP08575 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRCP08575 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRCP08575 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PTPRCP08575 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRCP08575 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRCP08575 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PTPRCP08575 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
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