Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI1P08151 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI1P08151 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI1P08151 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI1P08151 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI1P08151 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI1P08151 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI1P08151 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI1P08151 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI1P08151 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI1P08151 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI1P08151 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI1P08151 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI1P08151 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI1P08151 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI1P08151 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI1P08151 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GLI1P08151 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GLI1P08151 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GLI1P08151 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GLI1P08151 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GLI1P08151 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLI1P08151 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLI1P08151 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLI1P08151 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLI1P08151 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLI1P08151 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GLI1P08151 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLI1P08151 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLI1P08151 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLI1P08151 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GLI1P08151 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GLI1P08151 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GLI1P08151 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GLI1P08151 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GLI1P08151 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GLI1P08151 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GLI1P08151 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GLI1P08151 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLI1P08151 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLI1P08151 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GLI1P08151 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GLI1P08151 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GLI1P08151 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GLI1P08151 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GLI1P08151 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GLI1P08151 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GLI1P08151 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GLI1P08151 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLI1P08151 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GLI1P08151 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLI1P08151 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLI1P08151 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI1P08151 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI1P08151 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI1P08151 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI1P08151 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI1P08151 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI1P08151 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI1P08151 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI1P08151 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI1P08151 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI1P08151 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI1P08151 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI1P08151 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI1P08151 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI1P08151 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI1P08151 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI1P08151 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI1P08151 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI1P08151 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI1P08151 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI1P08151 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI1P08151 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI1P08151 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI1P08151 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI1P08151 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI1P08151 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI1P08151 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GLI1P08151 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI1P08151 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI1P08151 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI1P08151 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI1P08151 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI1P08151 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI1P08151 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI1P08151 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GLI1P08151 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI1P08151 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI1P08151 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GLI1P08151 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI1P08151 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI1P08151 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI1P08151 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI1P08151 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GLI1P08151 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI1P08151 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI1P08151 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI1P08151 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GLI1P08151 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms