Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGF1P05230 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGF1P05230 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGF1P05230 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGF1P05230 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGF1P05230 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FGF1P05230 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGF1P05230 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGF1P05230 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGF1P05230 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGF1P05230 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FGF1P05230 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FGF1P05230 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGF1P05230 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGF1P05230 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FGF1P05230 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGF1P05230 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGF1P05230 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGF1P05230 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGF1P05230 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGF1P05230 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGF1P05230 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGF1P05230 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGF1P05230 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FGF1P05230 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGF1P05230 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGF1P05230 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FGF1P05230 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGF1P05230 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGF1P05230 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FGF1P05230 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGF1P05230 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGF1P05230 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGF1P05230 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGF1P05230 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGF1P05230 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGF1P05230 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGF1P05230 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGF1P05230 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FGF1P05230 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FGF1P05230 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FGF1P05230 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGF1P05230 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGF1P05230 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGF1P05230 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGF1P05230 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGF1P05230 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGF1P05230 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FGF1P05230 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGF1P05230 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGF1P05230 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FGF1P05230 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FGF1P05230 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGF1P05230 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGF1P05230 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGF1P05230 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGF1P05230 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FGF1P05230 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FGF1P05230 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGF1P05230 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGF1P05230 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGF1P05230 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGF1P05230 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGF1P05230 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGF1P05230 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGF1P05230 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FGF1P05230 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGF1P05230 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FGF1P05230 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGF1P05230 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGF1P05230 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGF1P05230 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FGF1P05230 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGF1P05230 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGF1P05230 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FGF1P05230 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FGF1P05230 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGF1P05230 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FGF1P05230 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FGF1P05230 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGF1P05230 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FGF1P05230 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGF1P05230 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGF1P05230 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGF1P05230 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FGF1P05230 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FGF1P05230 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FGF1P05230 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGF1P05230 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGF1P05230 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGF1P05230 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGF1P05230 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGF1P05230 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGF1P05230 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGF1P05230 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGF1P05230 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGF1P05230 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGF1P05230 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGF1P05230 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FGF1P05230 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms