Protein–RNA interactions for Protein: P04264

KRT1, Keratin, type II cytoskeletal 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT1P04264 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT1P04264 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT1P04264 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT1P04264 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT1P04264 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT1P04264 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT1P04264 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT1P04264 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT1P04264 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT1P04264 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT1P04264 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT1P04264 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT1P04264 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT1P04264 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT1P04264 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT1P04264 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT1P04264 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT1P04264 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT1P04264 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT1P04264 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT1P04264 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT1P04264 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT1P04264 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT1P04264 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT1P04264 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT1P04264 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT1P04264 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT1P04264 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT1P04264 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT1P04264 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT1P04264 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT1P04264 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT1P04264 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT1P04264 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT1P04264 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT1P04264 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT1P04264 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT1P04264 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KRT1P04264 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT1P04264 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT1P04264 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT1P04264 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT1P04264 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT1P04264 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT1P04264 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT1P04264 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT1P04264 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT1P04264 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT1P04264 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT1P04264 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT1P04264 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT1P04264 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT1P04264 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT1P04264 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT1P04264 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT1P04264 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT1P04264 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT1P04264 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT1P04264 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT1P04264 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT1P04264 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT1P04264 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT1P04264 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT1P04264 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT1P04264 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT1P04264 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT1P04264 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT1P04264 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT1P04264 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT1P04264 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT1P04264 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT1P04264 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT1P04264 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
KRT1P04264 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT1P04264 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT1P04264 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT1P04264 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT1P04264 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT1P04264 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT1P04264 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT1P04264 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT1P04264 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT1P04264 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT1P04264 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT1P04264 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT1P04264 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT1P04264 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT1P04264 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT1P04264 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT1P04264 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT1P04264 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT1P04264 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT1P04264 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT1P04264 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT1P04264 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT1P04264 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT1P04264 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT1P04264 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT1P04264 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT1P04264 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms