Protein–RNA interactions for Protein: P03905

MT-ND4, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND4P03905 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MT-ND4P03905 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MT-ND4P03905 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MT-ND4P03905 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MT-ND4P03905 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MT-ND4P03905 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MT-ND4P03905 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms