Protein–RNA interactions for Protein: P00846

MT-ATP6, ATP synthase subunit a, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ATP6P00846 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ATP6P00846 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ATP6P00846 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ATP6P00846 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ATP6P00846 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ATP6P00846 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MT-ATP6P00846 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MT-ATP6P00846 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MT-ATP6P00846 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MT-ATP6P00846 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MT-ATP6P00846 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MT-ATP6P00846 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MT-ATP6P00846 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MT-ATP6P00846 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MT-ATP6P00846 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MT-ATP6P00846 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MT-ATP6P00846 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MT-ATP6P00846 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MT-ATP6P00846 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MT-ATP6P00846 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ATP6P00846 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ATP6P00846 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ATP6P00846 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ATP6P00846 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-ATP6P00846 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-ATP6P00846 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-ATP6P00846 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ATP6P00846 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ATP6P00846 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ATP6P00846 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ATP6P00846 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ATP6P00846 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ATP6P00846 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MT-ATP6P00846 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MT-ATP6P00846 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MT-ATP6P00846 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MT-ATP6P00846 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MT-ATP6P00846 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms