Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYF2O95926 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SYF2O95926 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYF2O95926 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYF2O95926 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYF2O95926 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYF2O95926 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYF2O95926 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYF2O95926 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYF2O95926 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYF2O95926 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYF2O95926 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYF2O95926 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYF2O95926 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SYF2O95926 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SYF2O95926 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYF2O95926 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYF2O95926 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYF2O95926 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYF2O95926 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYF2O95926 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYF2O95926 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYF2O95926 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYF2O95926 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYF2O95926 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYF2O95926 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYF2O95926 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYF2O95926 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYF2O95926 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYF2O95926 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYF2O95926 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYF2O95926 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYF2O95926 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYF2O95926 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYF2O95926 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYF2O95926 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYF2O95926 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYF2O95926 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYF2O95926 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYF2O95926 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYF2O95926 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYF2O95926 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYF2O95926 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYF2O95926 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYF2O95926 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYF2O95926 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYF2O95926 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYF2O95926 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYF2O95926 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYF2O95926 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYF2O95926 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYF2O95926 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYF2O95926 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYF2O95926 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYF2O95926 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYF2O95926 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYF2O95926 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYF2O95926 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYF2O95926 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYF2O95926 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYF2O95926 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYF2O95926 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYF2O95926 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYF2O95926 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYF2O95926 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYF2O95926 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYF2O95926 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYF2O95926 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYF2O95926 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SYF2O95926 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYF2O95926 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYF2O95926 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYF2O95926 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYF2O95926 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYF2O95926 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SYF2O95926 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYF2O95926 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SYF2O95926 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYF2O95926 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYF2O95926 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYF2O95926 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYF2O95926 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYF2O95926 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SYF2O95926 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYF2O95926 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYF2O95926 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYF2O95926 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYF2O95926 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYF2O95926 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYF2O95926 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYF2O95926 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYF2O95926 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SYF2O95926 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYF2O95926 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYF2O95926 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYF2O95926 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYF2O95926 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYF2O95926 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYF2O95926 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYF2O95926 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms