Protein–RNA interactions for Protein: O95255

ABCC6, Multidrug resistance-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC6O95255 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ABCC6O95255 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ABCC6O95255 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ABCC6O95255 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ABCC6O95255 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ABCC6O95255 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
ABCC6O95255 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
ABCC6O95255 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ABCC6O95255 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ABCC6O95255 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ABCC6O95255 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ABCC6O95255 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ABCC6O95255 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
ABCC6O95255 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ABCC6O95255 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
ABCC6O95255 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ABCC6O95255 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ABCC6O95255 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ABCC6O95255 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ABCC6O95255 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ABCC6O95255 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ABCC6O95255 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCC6O95255 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCC6O95255 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ABCC6O95255 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ABCC6O95255 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ABCC6O95255 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ABCC6O95255 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ABCC6O95255 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ABCC6O95255 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ABCC6O95255 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ABCC6O95255 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ABCC6O95255 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ABCC6O95255 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
ABCC6O95255 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ABCC6O95255 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ABCC6O95255 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ABCC6O95255 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
ABCC6O95255 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ABCC6O95255 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ABCC6O95255 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ABCC6O95255 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ABCC6O95255 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ABCC6O95255 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ABCC6O95255 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ABCC6O95255 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
ABCC6O95255 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ABCC6O95255 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ABCC6O95255 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
ABCC6O95255 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ABCC6O95255 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ABCC6O95255 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ABCC6O95255 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ABCC6O95255 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ABCC6O95255 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ABCC6O95255 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ABCC6O95255 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ABCC6O95255 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ABCC6O95255 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC6O95255 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC6O95255 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC6O95255 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC6O95255 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC6O95255 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC6O95255 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ABCC6O95255 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ABCC6O95255 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC6O95255 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC6O95255 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.1
ABCC6O95255 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
ABCC6O95255 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC6O95255 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ABCC6O95255 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ABCC6O95255 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC6O95255 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC6O95255 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC6O95255 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC6O95255 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC6O95255 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC6O95255 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC6O95255 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC6O95255 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC6O95255 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC6O95255 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC6O95255 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC6O95255 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC6O95255 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC6O95255 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC6O95255 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC6O95255 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC6O95255 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC6O95255 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC6O95255 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC6O95255 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC6O95255 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC6O95255 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC6O95255 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC6O95255 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC6O95255 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC6O95255 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms