Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
USP19O94966 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
USP19O94966 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
USP19O94966 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
USP19O94966 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
USP19O94966 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
USP19O94966 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
USP19O94966 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
USP19O94966 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
USP19O94966 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
USP19O94966 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
USP19O94966 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
USP19O94966 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
USP19O94966 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
USP19O94966 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
USP19O94966 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
USP19O94966 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
USP19O94966 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
USP19O94966 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
USP19O94966 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
USP19O94966 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
USP19O94966 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
USP19O94966 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
USP19O94966 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
USP19O94966 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
USP19O94966 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
USP19O94966 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
USP19O94966 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
USP19O94966 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
USP19O94966 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
USP19O94966 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
USP19O94966 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
USP19O94966 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
USP19O94966 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
USP19O94966 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
USP19O94966 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
USP19O94966 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
USP19O94966 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
USP19O94966 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
USP19O94966 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
USP19O94966 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
USP19O94966 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
USP19O94966 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
USP19O94966 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
USP19O94966 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
USP19O94966 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
USP19O94966 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
USP19O94966 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
USP19O94966 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
USP19O94966 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
USP19O94966 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
USP19O94966 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
USP19O94966 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
USP19O94966 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
USP19O94966 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
USP19O94966 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
USP19O94966 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
USP19O94966 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
USP19O94966 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
USP19O94966 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
USP19O94966 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
USP19O94966 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
USP19O94966 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
USP19O94966 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
USP19O94966 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
USP19O94966 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
USP19O94966 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
USP19O94966 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
USP19O94966 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
USP19O94966 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
USP19O94966 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
USP19O94966 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
USP19O94966 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
USP19O94966 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
USP19O94966 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
USP19O94966 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
USP19O94966 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
USP19O94966 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
USP19O94966 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
USP19O94966 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
USP19O94966 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
USP19O94966 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
USP19O94966 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
USP19O94966 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
USP19O94966 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
USP19O94966 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
USP19O94966 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
USP19O94966 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
USP19O94966 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
USP19O94966 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
USP19O94966 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
USP19O94966 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
USP19O94966 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
USP19O94966 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
USP19O94966 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
USP19O94966 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
USP19O94966 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
USP19O94966 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
USP19O94966 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
USP19O94966 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms