Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPC4O75487 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC4O75487 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC4O75487 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC4O75487 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC4O75487 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPC4O75487 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC4O75487 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPC4O75487 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC4O75487 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC4O75487 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC4O75487 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC4O75487 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC4O75487 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC4O75487 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPC4O75487 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC4O75487 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC4O75487 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPC4O75487 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC4O75487 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC4O75487 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPC4O75487 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPC4O75487 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPC4O75487 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPC4O75487 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPC4O75487 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC4O75487 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC4O75487 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC4O75487 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC4O75487 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC4O75487 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC4O75487 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPC4O75487 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC4O75487 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC4O75487 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC4O75487 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GPC4O75487 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC4O75487 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC4O75487 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC4O75487 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC4O75487 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC4O75487 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GPC4O75487 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC4O75487 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC4O75487 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC4O75487 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC4O75487 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC4O75487 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC4O75487 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC4O75487 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC4O75487 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC4O75487 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC4O75487 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC4O75487 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC4O75487 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC4O75487 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC4O75487 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC4O75487 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC4O75487 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC4O75487 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC4O75487 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC4O75487 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC4O75487 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC4O75487 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC4O75487 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC4O75487 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC4O75487 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC4O75487 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC4O75487 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC4O75487 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC4O75487 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC4O75487 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC4O75487 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC4O75487 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC4O75487 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC4O75487 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC4O75487 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC4O75487 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC4O75487 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC4O75487 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC4O75487 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC4O75487 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC4O75487 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC4O75487 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC4O75487 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC4O75487 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC4O75487 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC4O75487 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC4O75487 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC4O75487 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC4O75487 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC4O75487 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC4O75487 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC4O75487 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPC4O75487 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC4O75487 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC4O75487 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC4O75487 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC4O75487 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GPC4O75487 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms