Protein–RNA interactions for Protein: O75131

CPNE3, Copine-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE3O75131 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CPNE3O75131 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPNE3O75131 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPNE3O75131 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CPNE3O75131 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPNE3O75131 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPNE3O75131 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPNE3O75131 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPNE3O75131 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPNE3O75131 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPNE3O75131 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPNE3O75131 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CPNE3O75131 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPNE3O75131 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPNE3O75131 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPNE3O75131 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPNE3O75131 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPNE3O75131 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPNE3O75131 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPNE3O75131 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPNE3O75131 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPNE3O75131 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPNE3O75131 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPNE3O75131 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPNE3O75131 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPNE3O75131 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPNE3O75131 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE3O75131 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE3O75131 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms