Protein–RNA interactions for Protein: O60869

EDF1, Endothelial differentiation-related factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDF1O60869 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDF1O60869 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EDF1O60869 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDF1O60869 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EDF1O60869 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDF1O60869 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDF1O60869 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDF1O60869 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EDF1O60869 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDF1O60869 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EDF1O60869 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDF1O60869 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDF1O60869 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EDF1O60869 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDF1O60869 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EDF1O60869 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDF1O60869 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDF1O60869 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDF1O60869 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDF1O60869 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EDF1O60869 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDF1O60869 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDF1O60869 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDF1O60869 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDF1O60869 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EDF1O60869 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDF1O60869 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDF1O60869 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDF1O60869 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDF1O60869 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDF1O60869 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDF1O60869 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDF1O60869 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDF1O60869 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDF1O60869 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDF1O60869 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDF1O60869 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDF1O60869 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDF1O60869 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDF1O60869 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDF1O60869 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EDF1O60869 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDF1O60869 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDF1O60869 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDF1O60869 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EDF1O60869 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EDF1O60869 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EDF1O60869 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDF1O60869 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDF1O60869 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDF1O60869 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDF1O60869 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDF1O60869 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDF1O60869 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDF1O60869 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDF1O60869 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EDF1O60869 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDF1O60869 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDF1O60869 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDF1O60869 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDF1O60869 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDF1O60869 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDF1O60869 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDF1O60869 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDF1O60869 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDF1O60869 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDF1O60869 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDF1O60869 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDF1O60869 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDF1O60869 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDF1O60869 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDF1O60869 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDF1O60869 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDF1O60869 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDF1O60869 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDF1O60869 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDF1O60869 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDF1O60869 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDF1O60869 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDF1O60869 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDF1O60869 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDF1O60869 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDF1O60869 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDF1O60869 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EDF1O60869 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDF1O60869 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDF1O60869 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDF1O60869 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDF1O60869 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDF1O60869 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EDF1O60869 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDF1O60869 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDF1O60869 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EDF1O60869 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDF1O60869 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDF1O60869 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDF1O60869 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EDF1O60869 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDF1O60869 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDF1O60869 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms