Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CUBNO60494 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUBNO60494 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUBNO60494 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CUBNO60494 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CUBNO60494 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUBNO60494 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUBNO60494 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUBNO60494 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUBNO60494 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUBNO60494 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CUBNO60494 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUBNO60494 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUBNO60494 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUBNO60494 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUBNO60494 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CUBNO60494 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUBNO60494 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUBNO60494 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUBNO60494 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUBNO60494 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUBNO60494 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUBNO60494 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUBNO60494 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUBNO60494 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUBNO60494 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUBNO60494 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUBNO60494 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUBNO60494 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUBNO60494 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUBNO60494 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUBNO60494 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CUBNO60494 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUBNO60494 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUBNO60494 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUBNO60494 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUBNO60494 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUBNO60494 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUBNO60494 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUBNO60494 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUBNO60494 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUBNO60494 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUBNO60494 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUBNO60494 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUBNO60494 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUBNO60494 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUBNO60494 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUBNO60494 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUBNO60494 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUBNO60494 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUBNO60494 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUBNO60494 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUBNO60494 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUBNO60494 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUBNO60494 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUBNO60494 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUBNO60494 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CUBNO60494 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUBNO60494 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUBNO60494 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUBNO60494 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUBNO60494 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUBNO60494 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CUBNO60494 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUBNO60494 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUBNO60494 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUBNO60494 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CUBNO60494 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUBNO60494 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUBNO60494 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CUBNO60494 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUBNO60494 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUBNO60494 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CUBNO60494 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUBNO60494 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUBNO60494 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CUBNO60494 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CUBNO60494 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUBNO60494 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUBNO60494 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUBNO60494 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CUBNO60494 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CUBNO60494 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUBNO60494 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUBNO60494 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUBNO60494 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CUBNO60494 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CUBNO60494 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUBNO60494 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CUBNO60494 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUBNO60494 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUBNO60494 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUBNO60494 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CUBNO60494 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUBNO60494 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUBNO60494 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUBNO60494 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUBNO60494 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUBNO60494 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CUBNO60494 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms