Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL13O43927 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL13O43927 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL13O43927 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL13O43927 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL13O43927 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL13O43927 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL13O43927 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL13O43927 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL13O43927 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL13O43927 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL13O43927 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL13O43927 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL13O43927 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL13O43927 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL13O43927 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL13O43927 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CXCL13O43927 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL13O43927 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms