Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCO2O43819 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCO2O43819 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCO2O43819 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCO2O43819 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCO2O43819 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCO2O43819 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCO2O43819 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCO2O43819 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCO2O43819 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCO2O43819 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCO2O43819 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCO2O43819 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCO2O43819 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCO2O43819 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCO2O43819 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCO2O43819 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCO2O43819 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCO2O43819 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCO2O43819 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCO2O43819 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCO2O43819 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCO2O43819 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCO2O43819 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCO2O43819 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCO2O43819 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCO2O43819 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCO2O43819 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCO2O43819 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCO2O43819 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCO2O43819 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCO2O43819 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCO2O43819 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCO2O43819 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCO2O43819 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SCO2O43819 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCO2O43819 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCO2O43819 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCO2O43819 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCO2O43819 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCO2O43819 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCO2O43819 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCO2O43819 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCO2O43819 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCO2O43819 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCO2O43819 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCO2O43819 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCO2O43819 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCO2O43819 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCO2O43819 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCO2O43819 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCO2O43819 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCO2O43819 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCO2O43819 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCO2O43819 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCO2O43819 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCO2O43819 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCO2O43819 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCO2O43819 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCO2O43819 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCO2O43819 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCO2O43819 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCO2O43819 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCO2O43819 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SCO2O43819 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCO2O43819 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCO2O43819 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCO2O43819 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCO2O43819 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCO2O43819 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCO2O43819 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCO2O43819 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCO2O43819 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCO2O43819 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCO2O43819 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCO2O43819 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCO2O43819 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCO2O43819 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCO2O43819 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCO2O43819 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCO2O43819 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCO2O43819 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCO2O43819 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCO2O43819 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCO2O43819 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCO2O43819 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCO2O43819 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCO2O43819 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCO2O43819 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCO2O43819 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCO2O43819 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCO2O43819 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCO2O43819 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCO2O43819 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCO2O43819 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCO2O43819 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCO2O43819 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCO2O43819 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCO2O43819 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCO2O43819 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms