Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITM2AO43736 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITM2AO43736 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ITM2AO43736 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITM2AO43736 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITM2AO43736 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITM2AO43736 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITM2AO43736 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITM2AO43736 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITM2AO43736 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITM2AO43736 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITM2AO43736 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITM2AO43736 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITM2AO43736 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITM2AO43736 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITM2AO43736 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITM2AO43736 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITM2AO43736 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITM2AO43736 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITM2AO43736 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITM2AO43736 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITM2AO43736 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITM2AO43736 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITM2AO43736 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITM2AO43736 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITM2AO43736 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITM2AO43736 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ITM2AO43736 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITM2AO43736 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITM2AO43736 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITM2AO43736 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITM2AO43736 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITM2AO43736 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITM2AO43736 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITM2AO43736 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITM2AO43736 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITM2AO43736 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITM2AO43736 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITM2AO43736 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITM2AO43736 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITM2AO43736 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITM2AO43736 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITM2AO43736 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITM2AO43736 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITM2AO43736 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms