Protein–RNA interactions for Protein: O00255

MEN1, Menin, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEN1O00255 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MEN1O00255 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MEN1O00255 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEN1O00255 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEN1O00255 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEN1O00255 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MEN1O00255 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEN1O00255 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEN1O00255 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEN1O00255 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEN1O00255 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEN1O00255 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEN1O00255 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEN1O00255 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEN1O00255 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEN1O00255 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEN1O00255 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEN1O00255 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MEN1O00255 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MEN1O00255 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEN1O00255 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MEN1O00255 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEN1O00255 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEN1O00255 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEN1O00255 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEN1O00255 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEN1O00255 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEN1O00255 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEN1O00255 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEN1O00255 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MEN1O00255 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEN1O00255 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEN1O00255 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEN1O00255 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MEN1O00255 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MEN1O00255 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEN1O00255 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEN1O00255 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MEN1O00255 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEN1O00255 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEN1O00255 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEN1O00255 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEN1O00255 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEN1O00255 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MEN1O00255 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEN1O00255 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEN1O00255 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MEN1O00255 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEN1O00255 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEN1O00255 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEN1O00255 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEN1O00255 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEN1O00255 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MEN1O00255 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEN1O00255 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEN1O00255 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEN1O00255 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MEN1O00255 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MEN1O00255 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEN1O00255 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEN1O00255 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEN1O00255 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEN1O00255 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEN1O00255 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEN1O00255 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEN1O00255 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEN1O00255 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEN1O00255 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEN1O00255 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEN1O00255 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEN1O00255 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MEN1O00255 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEN1O00255 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEN1O00255 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEN1O00255 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEN1O00255 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEN1O00255 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEN1O00255 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEN1O00255 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEN1O00255 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEN1O00255 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEN1O00255 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MEN1O00255 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEN1O00255 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEN1O00255 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEN1O00255 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEN1O00255 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEN1O00255 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEN1O00255 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEN1O00255 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEN1O00255 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEN1O00255 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEN1O00255 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEN1O00255 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEN1O00255 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEN1O00255 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEN1O00255 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEN1O00255 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEN1O00255 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEN1O00255 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms