Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
J3KR12 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
J3KR12 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
J3KR12 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
J3KR12 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
J3KR12 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
J3KR12 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
J3KR12 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
J3KR12 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
J3KR12 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
J3KR12 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
J3KR12 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
J3KR12 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
J3KR12 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
J3KR12 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
J3KR12 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
J3KR12 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
J3KR12 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
J3KR12 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
J3KR12 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
J3KR12 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
J3KR12 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
J3KR12 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
J3KR12 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
J3KR12 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
J3KR12 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
J3KR12 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
J3KR12 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
J3KR12 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
J3KR12 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
J3KR12 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
J3KR12 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
J3KR12 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
J3KR12 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
J3KR12 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
J3KR12 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
J3KR12 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
J3KR12 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
J3KR12 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
J3KR12 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
J3KR12 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
J3KR12 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
J3KR12 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
J3KR12 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
J3KR12 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
J3KR12 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
J3KR12 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
J3KR12 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
J3KR12 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
J3KR12 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
J3KR12 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
J3KR12 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
J3KR12 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
J3KR12 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
J3KR12 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
J3KR12 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
J3KR12 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
J3KR12 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
J3KR12 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
J3KR12 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
J3KR12 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
J3KR12 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
J3KR12 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
J3KR12 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
J3KR12 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
J3KR12 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
J3KR12 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
J3KR12 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
J3KR12 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
J3KR12 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
J3KR12 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
J3KR12 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
J3KR12 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
J3KR12 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
J3KR12 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
J3KR12 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
J3KR12 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
J3KR12 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
J3KR12 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
J3KR12 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
J3KR12 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
J3KR12 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
J3KR12 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
J3KR12 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
J3KR12 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
J3KR12 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
J3KR12 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
J3KR12 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
J3KR12 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
J3KR12 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
J3KR12 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
J3KR12 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
J3KR12 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
J3KR12 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
J3KR12 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
J3KR12 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
J3KR12 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
J3KR12 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
J3KR12 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
J3KR12 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms