Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC188H7C350 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC188H7C350 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC188H7C350 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC188H7C350 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC188H7C350 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC188H7C350 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC188H7C350 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC188H7C350 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC188H7C350 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC188H7C350 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC188H7C350 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC188H7C350 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC188H7C350 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC188H7C350 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC188H7C350 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC188H7C350 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC188H7C350 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC188H7C350 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC188H7C350 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC188H7C350 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC188H7C350 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC188H7C350 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC188H7C350 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC188H7C350 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC188H7C350 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC188H7C350 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC188H7C350 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC188H7C350 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC188H7C350 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC188H7C350 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC188H7C350 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC188H7C350 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC188H7C350 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC188H7C350 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC188H7C350 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC188H7C350 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC188H7C350 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC188H7C350 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC188H7C350 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms