Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
H3BQV1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
H3BQV1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
H3BQV1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
H3BQV1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
H3BQV1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
H3BQV1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
H3BQV1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
H3BQV1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
H3BQV1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
H3BQV1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
H3BQV1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
H3BQV1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
H3BQV1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
H3BQV1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
H3BQV1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
H3BQV1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
H3BQV1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
H3BQV1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
H3BQV1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
H3BQV1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
H3BQV1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
H3BQV1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
H3BQV1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
H3BQV1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
H3BQV1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
H3BQV1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
H3BQV1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
H3BQV1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
H3BQV1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
H3BQV1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
H3BQV1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
H3BQV1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
H3BQV1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
H3BQV1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
H3BQV1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
H3BQV1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
H3BQV1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
H3BQV1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
H3BQV1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
H3BQV1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
H3BQV1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
H3BQV1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
H3BQV1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
H3BQV1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
H3BQV1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
H3BQV1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
H3BQV1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
H3BQV1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
H3BQV1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
H3BQV1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
H3BQV1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
H3BQV1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
H3BQV1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
H3BQV1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
H3BQV1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
H3BQV1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
H3BQV1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
H3BQV1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
H3BQV1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
H3BQV1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
H3BQV1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
H3BQV1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
H3BQV1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
H3BQV1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
H3BQV1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
H3BQV1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
H3BQV1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
H3BQV1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
H3BQV1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
H3BQV1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
H3BQV1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
H3BQV1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
H3BQV1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
H3BQV1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
H3BQV1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
H3BQV1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
H3BQV1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
H3BQV1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
H3BQV1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
H3BQV1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
H3BQV1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
H3BQV1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
H3BQV1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
H3BQV1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
H3BQV1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
H3BQV1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
H3BQV1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
H3BQV1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
H3BQV1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
H3BQV1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
H3BQV1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
H3BQV1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
H3BQV1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
H3BQV1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
H3BQV1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
H3BQV1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
H3BQV1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
H3BQV1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
H3BQV1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms