Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA8SH3BPF8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA8SH3BPF8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA8SH3BPF8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA8SH3BPF8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA8SH3BPF8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA8SH3BPF8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA8SH3BPF8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA8SH3BPF8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA8SH3BPF8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA8SH3BPF8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA8SH3BPF8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms