Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
B4DXG7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
B4DXG7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
B4DXG7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
B4DXG7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
B4DXG7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
B4DXG7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
B4DXG7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B4DXG7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B4DXG7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B4DXG7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
B4DXG7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
B4DXG7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
B4DXG7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
B4DXG7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
B4DXG7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
B4DXG7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
B4DXG7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
B4DXG7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
B4DXG7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
B4DXG7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
B4DXG7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B4DXG7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
B4DXG7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
B4DXG7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
B4DXG7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
B4DXG7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
B4DXG7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
B4DXG7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
B4DXG7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
B4DXG7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
B4DXG7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
B4DXG7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
B4DXG7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
B4DXG7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
B4DXG7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
B4DXG7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
B4DXG7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
B4DXG7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
B4DXG7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
B4DXG7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
B4DXG7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
B4DXG7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
B4DXG7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B4DXG7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
B4DXG7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
B4DXG7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
B4DXG7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B4DXG7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
B4DXG7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B4DXG7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B4DXG7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
B4DXG7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
B4DXG7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
B4DXG7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
B4DXG7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
B4DXG7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
B4DXG7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
B4DXG7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B4DXG7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
B4DXG7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
B4DXG7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4DXG7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4DXG7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4DXG7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B4DXG7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4DXG7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4DXG7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4DXG7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B4DXG7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
B4DXG7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
B4DXG7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
B4DXG7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
B4DXG7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
B4DXG7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4DXG7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4DXG7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4DXG7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4DXG7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4DXG7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4DXG7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4DXG7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B4DXG7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B4DXG7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
B4DXG7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
B4DXG7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
B4DXG7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B4DXG7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B4DXG7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B4DXG7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
B4DXG7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
B4DXG7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
B4DXG7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
B4DXG7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B4DXG7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B4DXG7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
B4DXG7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
B4DXG7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
B4DXG7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
B4DXG7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms