Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC169A6NNP5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC169A6NNP5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC169A6NNP5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC169A6NNP5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC169A6NNP5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC169A6NNP5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC169A6NNP5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC169A6NNP5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC169A6NNP5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC169A6NNP5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC169A6NNP5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC169A6NNP5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC169A6NNP5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC169A6NNP5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC169A6NNP5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC169A6NNP5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC169A6NNP5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC169A6NNP5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC169A6NNP5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC169A6NNP5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC169A6NNP5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC169A6NNP5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC169A6NNP5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC169A6NNP5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC169A6NNP5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC169A6NNP5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC169A6NNP5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC169A6NNP5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC169A6NNP5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC169A6NNP5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC169A6NNP5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC169A6NNP5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms