Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBAL3A6NHL2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBAL3A6NHL2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBAL3A6NHL2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBAL3A6NHL2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBAL3A6NHL2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBAL3A6NHL2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBAL3A6NHL2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBAL3A6NHL2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBAL3A6NHL2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBAL3A6NHL2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBAL3A6NHL2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBAL3A6NHL2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBAL3A6NHL2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBAL3A6NHL2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBAL3A6NHL2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBAL3A6NHL2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBAL3A6NHL2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBAL3A6NHL2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBAL3A6NHL2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBAL3A6NHL2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms