Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTAGE9A4FU28 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTAGE9A4FU28 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTAGE9A4FU28 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTAGE9A4FU28 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTAGE9A4FU28 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTAGE9A4FU28 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTAGE9A4FU28 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTAGE9A4FU28 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTAGE9A4FU28 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTAGE9A4FU28 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTAGE9A4FU28 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTAGE9A4FU28 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTAGE9A4FU28 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CTAGE9A4FU28 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTAGE9A4FU28 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTAGE9A4FU28 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTAGE9A4FU28 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTAGE9A4FU28 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTAGE9A4FU28 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTAGE9A4FU28 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTAGE9A4FU28 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CTAGE9A4FU28 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTAGE9A4FU28 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTAGE9A4FU28 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTAGE9A4FU28 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTAGE9A4FU28 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTAGE9A4FU28 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CTAGE9A4FU28 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTAGE9A4FU28 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTAGE9A4FU28 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTAGE9A4FU28 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTAGE9A4FU28 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTAGE9A4FU28 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTAGE9A4FU28 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTAGE9A4FU28 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTAGE9A4FU28 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTAGE9A4FU28 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CTAGE9A4FU28 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTAGE9A4FU28 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTAGE9A4FU28 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTAGE9A4FU28 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTAGE9A4FU28 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTAGE9A4FU28 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTAGE9A4FU28 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTAGE9A4FU28 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTAGE9A4FU28 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTAGE9A4FU28 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTAGE9A4FU28 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTAGE9A4FU28 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTAGE9A4FU28 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTAGE9A4FU28 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTAGE9A4FU28 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTAGE9A4FU28 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTAGE9A4FU28 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTAGE9A4FU28 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTAGE9A4FU28 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTAGE9A4FU28 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTAGE9A4FU28 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTAGE9A4FU28 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTAGE9A4FU28 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CTAGE9A4FU28 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTAGE9A4FU28 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTAGE9A4FU28 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms