Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQV5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQV5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQV5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQV5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQV5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQV5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A0U1RQV5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQV5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RQV5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQV5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQV5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQV5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQV5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQV5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQV5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQV5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQV5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RQV5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQV5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RQV5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQV5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQV5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RQV5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQV5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQV5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQV5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RQV5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQV5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQV5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RQV5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A0U1RQV5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQV5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RQV5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQV5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQV5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQV5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RQV5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms