Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYG9

ARPC4-TTLL3, Protein ARPC4-TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms