Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CGGBP1Q9UFW8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CGGBP1Q9UFW8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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