RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600910.5

PNKP-215, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PNKP, Length 1,600 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-215ENST00000600910 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.25■■■■■ 5.32
PNKP-215ENST00000600910 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.53■■■■■ 4.4
PNKP-215ENST00000600910 ABCC9O60706 1549 aa40.94■■■■■ 4.14
PNKP-215ENST00000600910 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
PNKP-215ENST00000600910 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.07■■■■■ 4.01
PNKP-215ENST00000600910 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.92■■■■□ 3.98
PNKP-215ENST00000600910 NACADO15069 1562 aa39.81■■■■□ 3.96
PNKP-215ENST00000600910 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.79■■■■□ 3.96
PNKP-215ENST00000600910 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.67■■■■□ 3.94
PNKP-215ENST00000600910 SCRIBQ14160 1630 aa38.94■■■■□ 3.82
PNKP-215ENST00000600910 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.81■■■■□ 3.8
PNKP-215ENST00000600910 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.67■■■■□ 3.78
PNKP-215ENST00000600910 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.47■■■■□ 3.75
PNKP-215ENST00000600910 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.41■■■■□ 3.745e-6■■■■□ 22.2
PNKP-215ENST00000600910 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.53■■■■□ 3.6
PNKP-215ENST00000600910 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
PNKP-215ENST00000600910 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.34■■■■□ 3.57
PNKP-215ENST00000600910 SMARCA4P51532 1647 aa37.28■■■■□ 3.56
PNKP-215ENST00000600910 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.23■■■■□ 3.55
PNKP-215ENST00000600910 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.53
PNKP-215ENST00000600910 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.05■■■■□ 3.52
PNKP-215ENST00000600910 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.88■■■■□ 3.5
PNKP-215ENST00000600910 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.88■■■■□ 3.5
PNKP-215ENST00000600910 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.88■■■■□ 3.49
PNKP-215ENST00000600910 WIZO95785 1651 aa36.87■■■■□ 3.49
PNKP-215ENST00000600910 SMARCA2P51531 1590 aa36.86■■■■□ 3.49
PNKP-215ENST00000600910 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
PNKP-215ENST00000600910 NCAPD3P42695 1498 aa36.73■■■■□ 3.47
PNKP-215ENST00000600910 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
PNKP-215ENST00000600910 HMGXB3Q12766 1538 aa36.62■■■■□ 3.45
PNKP-215ENST00000600910 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
PNKP-215ENST00000600910 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.08■■■■□ 3.37
PNKP-215ENST00000600910 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.72■■■■□ 3.31
PNKP-215ENST00000600910 NESP48681 1621 aa35.66■■■■□ 3.3
PNKP-215ENST00000600910 CFTRP13569 1480 aa35.66■■■■□ 3.3
PNKP-215ENST00000600910 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.64■■■■□ 3.3
PNKP-215ENST00000600910 PRDM2Q13029 1718 aa35.45■■■■□ 3.27
PNKP-215ENST00000600910 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.38■■■■□ 3.25
PNKP-215ENST00000600910 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.32■■■■□ 3.24
PNKP-215ENST00000600910 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.26■■■■□ 3.23
PNKP-215ENST00000600910 ERCC6Q03468 1493 aa35.21■■■■□ 3.23
PNKP-215ENST00000600910 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.19■■■■□ 3.22
PNKP-215ENST00000600910 ABCC8Q09428 1581 aa35.04■■■■□ 3.2
PNKP-215ENST00000600910 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.97■■■■□ 3.19
PNKP-215ENST00000600910 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.93■■■■□ 3.18
PNKP-215ENST00000600910 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
PNKP-215ENST00000600910 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
PNKP-215ENST00000600910 CUX1P39880 1505 aa34.87■■■■□ 3.17
PNKP-215ENST00000600910 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.85■■■■□ 3.17
PNKP-215ENST00000600910 TOPBP1Q92547 1522 aa34.84■■■■□ 3.17
PNKP-215ENST00000600910 WDR62O43379 1518 aa34.83■■■■□ 3.17
PNKP-215ENST00000600910 SYNJ1O43426 1573 aa34.82■■■■□ 3.16
PNKP-215ENST00000600910 TOP2BQ02880 1626 aa34.76■■■■□ 3.16
PNKP-215ENST00000600910 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.75■■■■□ 3.15
PNKP-215ENST00000600910 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.74■■■■□ 3.15
PNKP-215ENST00000600910 TRIM41Q8WV44 630 aa34.66■■■■□ 3.14
PNKP-215ENST00000600910 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.63■■■■□ 3.13
PNKP-215ENST00000600910 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
PNKP-215ENST00000600910 CUX2O14529 1486 aa34.52■■■■□ 3.12
PNKP-215ENST00000600910 SOGA1O94964 1423 aa34.47■■■■□ 3.11
PNKP-215ENST00000600910 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.46■■■■□ 3.11
PNKP-215ENST00000600910 IFT140Q96RY7 1462 aa34.41■■■■□ 3.1
PNKP-215ENST00000600910 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
PNKP-215ENST00000600910 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.31■■■■□ 3.08
PNKP-215ENST00000600910 WDR97A6NE52 1622 aa34.3■■■■□ 3.08
PNKP-215ENST00000600910 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
PNKP-215ENST00000600910 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
PNKP-215ENST00000600910 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.14■■■■□ 3.062e-6■■■■□ 20.5
PNKP-215ENST00000600910 KIF27Q86VH2 1401 aa34.13■■■■□ 3.05
PNKP-215ENST00000600910 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
PNKP-215ENST00000600910 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.12■■■■□ 3.05
PNKP-215ENST00000600910 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.1■■■■□ 3.05
PNKP-215ENST00000600910 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.08■■■■□ 3.05
PNKP-215ENST00000600910 EEA1Q15075 1411 aa33.97■■■■□ 3.03
PNKP-215ENST00000600910 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
PNKP-215ENST00000600910 PBRM1Q86U86 1689 aa33.97■■■■□ 3.03
PNKP-215ENST00000600910 GRIN2BQ13224 1484 aa33.96■■■■□ 3.03
PNKP-215ENST00000600910 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.91■■■■□ 3.02
PNKP-215ENST00000600910 IGF1RP08069 1367 aa33.9■■■■□ 3.02
PNKP-215ENST00000600910 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.85■■■■□ 3.01
PNKP-215ENST00000600910 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.83■■■■□ 3.01
PNKP-215ENST00000600910 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.78■■■■□ 3
PNKP-215ENST00000600910 CUL7Q14999 1698 aa33.76■■■□□ 2.99
PNKP-215ENST00000600910 ADAMTS12P58397 1594 aa33.74■■■□□ 2.99
PNKP-215ENST00000600910 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.72■■■□□ 2.99
PNKP-215ENST00000600910 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.7■■■□□ 2.99
PNKP-215ENST00000600910 PRXQ9BXM0 1461 aa33.67■■■□□ 2.98
PNKP-215ENST00000600910 SYNJ2O15056 1496 aa33.65■■■□□ 2.98
PNKP-215ENST00000600910 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.61■■■□□ 2.97
PNKP-215ENST00000600910 FBLN2P98095 1184 aa33.6■■■□□ 2.97
PNKP-215ENST00000600910 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.59■■■□□ 2.97
PNKP-215ENST00000600910 KIF21BO75037 1637 aa33.58■■■□□ 2.97
PNKP-215ENST00000600910 GRIN2AQ12879 1464 aa33.54■■■□□ 2.96
PNKP-215ENST00000600910 CHD1O14646 1710 aa33.54■■■□□ 2.96
PNKP-215ENST00000600910 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.5■■■□□ 2.95
PNKP-215ENST00000600910 GOLGA3Q08378 1498 aa33.46■■■□□ 2.95
PNKP-215ENST00000600910 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.36■■■□□ 2.93
PNKP-215ENST00000600910 CEP170Q5SW79 1584 aa33.35■■■□□ 2.93
PNKP-215ENST00000600910 NUP160Q12769 1436 aa33.34■■■□□ 2.93
PNKP-215ENST00000600910 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.32■■■□□ 2.92
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