RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640715.1

SLC35A3-222, Transcript of solute carrier family 35 member A3, human

TSL 5 BASIC

Gene SLC35A3, Length 1,989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC35A3-222	ENST00000640715	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		45.8	■■■■■ 4.92
SLC35A3-222	ENST00000640715	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		39.95	■■■■□ 3.99
SLC35A3-222	ENST00000640715	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	38.42	■■■■□ 3.74
SLC35A3-222	ENST00000640715	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		38.04	■■■■□ 3.68
SLC35A3-222	ENST00000640715	ABCC9	O60706	1549 aa		38.02	■■■■□ 3.68
SLC35A3-222	ENST00000640715	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		37.82	■■■■□ 3.64
SLC35A3-222	ENST00000640715	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		37.42	■■■■□ 3.58
SLC35A3-222	ENST00000640715	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		37.37	■■■■□ 3.57
SLC35A3-222	ENST00000640715	NACAD	O15069	1562 aa		37.28	■■■■□ 3.56
SLC35A3-222	ENST00000640715	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37	■■■■□ 3.51
SLC35A3-222	ENST00000640715	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.79	■■■■□ 3.48
SLC35A3-222	ENST00000640715	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.26	■■■■□ 3.4
SLC35A3-222	ENST00000640715	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	35.91	■■■■□ 3.34
SLC35A3-222	ENST00000640715	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		35.89	■■■■□ 3.34
SLC35A3-222	ENST00000640715	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	35.88	■■■■□ 3.33
SLC35A3-222	ENST00000640715	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.64	■■■■□ 3.3
SLC35A3-222	ENST00000640715	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	35.5	■■■■□ 3.27
SLC35A3-222	ENST00000640715	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		35.4	■■■■□ 3.26
SLC35A3-222	ENST00000640715	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	35.36	■■■■□ 3.25
SLC35A3-222	ENST00000640715	SMARCA4	P51532	1647 aa		35.23	■■■■□ 3.23
SLC35A3-222	ENST00000640715	WIZ	O95785	1651 aa		35.11	■■■■□ 3.21
SLC35A3-222	ENST00000640715	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	34.83	■■■■□ 3.17
SLC35A3-222	ENST00000640715	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.77	■■■■□ 3.16
SLC35A3-222	ENST00000640715	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.71	■■■■□ 3.15
SLC35A3-222	ENST00000640715	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	34.7	■■■■□ 3.15
SLC35A3-222	ENST00000640715	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.66	■■■■□ 3.14
SLC35A3-222	ENST00000640715	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.51	■■■■□ 3.11
SLC35A3-222	ENST00000640715	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.43	■■■■□ 3.1
SLC35A3-222	ENST00000640715	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		34.39	■■■■□ 3.1
SLC35A3-222	ENST00000640715	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		34.37	■■■■□ 3.09
SLC35A3-222	ENST00000640715	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.33	■■■■□ 3.09
SLC35A3-222	ENST00000640715	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		34.26	■■■■□ 3.08
SLC35A3-222	ENST00000640715	TRIM41	Q8WV44	630 aa		33.75	■■■□□ 2.99
SLC35A3-222	ENST00000640715	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.71	■■■□□ 2.99
SLC35A3-222	ENST00000640715	ABCC8	Q09428	1581 aa		33.63	■■■□□ 2.97
SLC35A3-222	ENST00000640715	CFTR	P13569	1480 aa		33.63	■■■□□ 2.97
SLC35A3-222	ENST00000640715	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.56	■■■□□ 2.96
SLC35A3-222	ENST00000640715	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	33.43	■■■□□ 2.94
SLC35A3-222	ENST00000640715	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.4	■■■□□ 2.94
SLC35A3-222	ENST00000640715	NES	P48681	1621 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SLC35A3-222	ENST00000640715	SYNJ1	O43426	1573 aa		33.26	■■■□□ 2.92
SLC35A3-222	ENST00000640715	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.26	■■■□□ 2.92
SLC35A3-222	ENST00000640715	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SLC35A3-222	ENST00000640715	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
SLC35A3-222	ENST00000640715	TOP2B	Q02880	1626 aa		33.13	■■■□□ 2.89
SLC35A3-222	ENST00000640715	CUX1	P39880	1505 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SLC35A3-222	ENST00000640715	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SLC35A3-222	ENST00000640715	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SLC35A3-222	ENST00000640715	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		33	■■■□□ 2.87
SLC35A3-222	ENST00000640715	SOGA1	O94964	1423 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SLC35A3-222	ENST00000640715	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		32.98	■■■□□ 2.87
SLC35A3-222	ENST00000640715	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SLC35A3-222	ENST00000640715	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SLC35A3-222	ENST00000640715	EEA1	Q15075	1411 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SLC35A3-222	ENST00000640715	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SLC35A3-222	ENST00000640715	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SLC35A3-222	ENST00000640715	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SLC35A3-222	ENST00000640715	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
SLC35A3-222	ENST00000640715	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SLC35A3-222	ENST00000640715	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SLC35A3-222	ENST00000640715	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
SLC35A3-222	ENST00000640715	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SLC35A3-222	ENST00000640715	ERCC6	Q03468	1493 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SLC35A3-222	ENST00000640715	KIF27	Q86VH2	1401 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SLC35A3-222	ENST00000640715	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SLC35A3-222	ENST00000640715	CUX2	O14529	1486 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SLC35A3-222	ENST00000640715	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SLC35A3-222	ENST00000640715	WDR62	O43379	1518 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SLC35A3-222	ENST00000640715	KIF21B	O75037	1637 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SLC35A3-222	ENST00000640715	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SLC35A3-222	ENST00000640715	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
SLC35A3-222	ENST00000640715	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
SLC35A3-222	ENST00000640715	IGF1R	P08069	1367 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SLC35A3-222	ENST00000640715	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SLC35A3-222	ENST00000640715	PRX	Q9BXM0	1461 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SLC35A3-222	ENST00000640715	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SLC35A3-222	ENST00000640715	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
SLC35A3-222	ENST00000640715	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
SLC35A3-222	ENST00000640715	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SLC35A3-222	ENST00000640715	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SLC35A3-222	ENST00000640715	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SLC35A3-222	ENST00000640715	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SLC35A3-222	ENST00000640715	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SLC35A3-222	ENST00000640715	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SLC35A3-222	ENST00000640715	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SLC35A3-222	ENST00000640715	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.09	■■■□□ 2.73
SLC35A3-222	ENST00000640715	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
SLC35A3-222	ENST00000640715	CUL7	Q14999	1698 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SLC35A3-222	ENST00000640715	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SLC35A3-222	ENST00000640715	GRIN2B	Q13224	1484 aa		31.94	■■■□□ 2.7
SLC35A3-222	ENST00000640715	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
SLC35A3-222	ENST00000640715	CLIP1	P30622	1438 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SLC35A3-222	ENST00000640715	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
SLC35A3-222	ENST00000640715	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SLC35A3-222	ENST00000640715	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SLC35A3-222	ENST00000640715	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SLC35A3-222	ENST00000640715	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SLC35A3-222	ENST00000640715	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
SLC35A3-222	ENST00000640715	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		31.61	■■■□□ 2.65
SLC35A3-222	ENST00000640715	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.8 ms