Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y618

NCOR2, Nuclear receptor corepressor 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOR2Q9Y618 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCOR2Q9Y618 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCOR2Q9Y618 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCOR2Q9Y618 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCOR2Q9Y618 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOR2Q9Y618 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOR2Q9Y618 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCOR2Q9Y618 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOR2Q9Y618 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOR2Q9Y618 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCOR2Q9Y618 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOR2Q9Y618 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOR2Q9Y618 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCOR2Q9Y618 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCOR2Q9Y618 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOR2Q9Y618 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOR2Q9Y618 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOR2Q9Y618 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOR2Q9Y618 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOR2Q9Y618 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOR2Q9Y618 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCOR2Q9Y618 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOR2Q9Y618 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOR2Q9Y618 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCOR2Q9Y618 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOR2Q9Y618 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOR2Q9Y618 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOR2Q9Y618 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOR2Q9Y618 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOR2Q9Y618 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOR2Q9Y618 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOR2Q9Y618 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOR2Q9Y618 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOR2Q9Y618 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOR2Q9Y618 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOR2Q9Y618 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOR2Q9Y618 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOR2Q9Y618 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOR2Q9Y618 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOR2Q9Y618 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOR2Q9Y618 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOR2Q9Y618 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOR2Q9Y618 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOR2Q9Y618 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOR2Q9Y618 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCOR2Q9Y618 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOR2Q9Y618 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOR2Q9Y618 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOR2Q9Y618 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOR2Q9Y618 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCOR2Q9Y618 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCOR2Q9Y618 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOR2Q9Y618 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOR2Q9Y618 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOR2Q9Y618 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOR2Q9Y618 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCOR2Q9Y618 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOR2Q9Y618 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOR2Q9Y618 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCOR2Q9Y618 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOR2Q9Y618 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOR2Q9Y618 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOR2Q9Y618 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOR2Q9Y618 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NCOR2Q9Y618 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCOR2Q9Y618 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCOR2Q9Y618 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCOR2Q9Y618 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCOR2Q9Y618 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCOR2Q9Y618 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NCOR2Q9Y618 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCOR2Q9Y618 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCOR2Q9Y618 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCOR2Q9Y618 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCOR2Q9Y618 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCOR2Q9Y618 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCOR2Q9Y618 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCOR2Q9Y618 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCOR2Q9Y618 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOR2Q9Y618 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCOR2Q9Y618 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOR2Q9Y618 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOR2Q9Y618 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOR2Q9Y618 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCOR2Q9Y618 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCOR2Q9Y618 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCOR2Q9Y618 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOR2Q9Y618 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOR2Q9Y618 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOR2Q9Y618 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOR2Q9Y618 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCOR2Q9Y618 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NCOR2Q9Y618 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NCOR2Q9Y618 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NCOR2Q9Y618 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NCOR2Q9Y618 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCOR2Q9Y618 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NCOR2Q9Y618 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCOR2Q9Y618 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCOR2Q9Y618 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms