Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G0

PCDHGB5, Protocadherin gamma-B5, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB5Q9Y5G0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHGB5Q9Y5G0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHGB5Q9Y5G0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHGB5Q9Y5G0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHGB5Q9Y5G0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHGB5Q9Y5G0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHGB5Q9Y5G0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHGB5Q9Y5G0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHGB5Q9Y5G0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGB5Q9Y5G0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGB5Q9Y5G0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGB5Q9Y5G0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHGB5Q9Y5G0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGB5Q9Y5G0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGB5Q9Y5G0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGB5Q9Y5G0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGB5Q9Y5G0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGB5Q9Y5G0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHGB5Q9Y5G0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGB5Q9Y5G0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGB5Q9Y5G0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGB5Q9Y5G0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGB5Q9Y5G0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGB5Q9Y5G0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHGB5Q9Y5G0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHGB5Q9Y5G0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHGB5Q9Y5G0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHGB5Q9Y5G0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGB5Q9Y5G0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGB5Q9Y5G0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGB5Q9Y5G0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGB5Q9Y5G0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHGB5Q9Y5G0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHGB5Q9Y5G0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHGB5Q9Y5G0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHGB5Q9Y5G0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHGB5Q9Y5G0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHGB5Q9Y5G0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHGB5Q9Y5G0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHGB5Q9Y5G0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHGB5Q9Y5G0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHGB5Q9Y5G0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHGB5Q9Y5G0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHGB5Q9Y5G0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHGB5Q9Y5G0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHGB5Q9Y5G0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHGB5Q9Y5G0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHGB5Q9Y5G0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHGB5Q9Y5G0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHGB5Q9Y5G0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHGB5Q9Y5G0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHGB5Q9Y5G0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHGB5Q9Y5G0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHGB5Q9Y5G0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHGB5Q9Y5G0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHGB5Q9Y5G0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHGB5Q9Y5G0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHGB5Q9Y5G0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHGB5Q9Y5G0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHGB5Q9Y5G0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHGB5Q9Y5G0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHGB5Q9Y5G0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHGB5Q9Y5G0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHGB5Q9Y5G0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHGB5Q9Y5G0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHGB5Q9Y5G0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHGB5Q9Y5G0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHGB5Q9Y5G0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDHGB5Q9Y5G0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDHGB5Q9Y5G0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHGB5Q9Y5G0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHGB5Q9Y5G0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms