Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC42Q9Y546 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC42Q9Y546 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC42Q9Y546 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC42Q9Y546 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC42Q9Y546 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC42Q9Y546 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC42Q9Y546 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC42Q9Y546 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC42Q9Y546 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC42Q9Y546 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC42Q9Y546 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC42Q9Y546 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC42Q9Y546 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC42Q9Y546 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC42Q9Y546 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC42Q9Y546 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC42Q9Y546 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRC42Q9Y546 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRC42Q9Y546 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC42Q9Y546 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC42Q9Y546 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC42Q9Y546 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC42Q9Y546 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC42Q9Y546 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC42Q9Y546 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRC42Q9Y546 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC42Q9Y546 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC42Q9Y546 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC42Q9Y546 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC42Q9Y546 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC42Q9Y546 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC42Q9Y546 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC42Q9Y546 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC42Q9Y546 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC42Q9Y546 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC42Q9Y546 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC42Q9Y546 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC42Q9Y546 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC42Q9Y546 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC42Q9Y546 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC42Q9Y546 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC42Q9Y546 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC42Q9Y546 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC42Q9Y546 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC42Q9Y546 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC42Q9Y546 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC42Q9Y546 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC42Q9Y546 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC42Q9Y546 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC42Q9Y546 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC42Q9Y546 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC42Q9Y546 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms