Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FAN1Q9Y2M0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FAN1Q9Y2M0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FAN1Q9Y2M0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FAN1Q9Y2M0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FAN1Q9Y2M0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FAN1Q9Y2M0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FAN1Q9Y2M0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FAN1Q9Y2M0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAN1Q9Y2M0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FAN1Q9Y2M0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAN1Q9Y2M0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAN1Q9Y2M0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAN1Q9Y2M0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAN1Q9Y2M0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAN1Q9Y2M0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAN1Q9Y2M0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAN1Q9Y2M0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAN1Q9Y2M0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAN1Q9Y2M0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAN1Q9Y2M0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAN1Q9Y2M0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAN1Q9Y2M0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FAN1Q9Y2M0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAN1Q9Y2M0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAN1Q9Y2M0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAN1Q9Y2M0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAN1Q9Y2M0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAN1Q9Y2M0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAN1Q9Y2M0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAN1Q9Y2M0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAN1Q9Y2M0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAN1Q9Y2M0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAN1Q9Y2M0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAN1Q9Y2M0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAN1Q9Y2M0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAN1Q9Y2M0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAN1Q9Y2M0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAN1Q9Y2M0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAN1Q9Y2M0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FAN1Q9Y2M0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FAN1Q9Y2M0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms