Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM50BQ9Y247 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM50BQ9Y247 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM50BQ9Y247 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM50BQ9Y247 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM50BQ9Y247 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM50BQ9Y247 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM50BQ9Y247 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM50BQ9Y247 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM50BQ9Y247 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM50BQ9Y247 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM50BQ9Y247 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM50BQ9Y247 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM50BQ9Y247 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM50BQ9Y247 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM50BQ9Y247 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM50BQ9Y247 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FAM50BQ9Y247 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM50BQ9Y247 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM50BQ9Y247 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM50BQ9Y247 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM50BQ9Y247 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM50BQ9Y247 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM50BQ9Y247 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM50BQ9Y247 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM50BQ9Y247 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM50BQ9Y247 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM50BQ9Y247 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM50BQ9Y247 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM50BQ9Y247 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM50BQ9Y247 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM50BQ9Y247 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM50BQ9Y247 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM50BQ9Y247 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM50BQ9Y247 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM50BQ9Y247 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM50BQ9Y247 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
FAM50BQ9Y247 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FAM50BQ9Y247 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM50BQ9Y247 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FAM50BQ9Y247 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM50BQ9Y247 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM50BQ9Y247 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FAM50BQ9Y247 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FAM50BQ9Y247 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM50BQ9Y247 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FAM50BQ9Y247 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM50BQ9Y247 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FAM50BQ9Y247 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM50BQ9Y247 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM50BQ9Y247 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FAM50BQ9Y247 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM50BQ9Y247 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM50BQ9Y247 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM50BQ9Y247 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM50BQ9Y247 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM50BQ9Y247 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FAM50BQ9Y247 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM50BQ9Y247 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM50BQ9Y247 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM50BQ9Y247 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FAM50BQ9Y247 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM50BQ9Y247 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FAM50BQ9Y247 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM50BQ9Y247 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM50BQ9Y247 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FAM50BQ9Y247 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM50BQ9Y247 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM50BQ9Y247 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FAM50BQ9Y247 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM50BQ9Y247 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM50BQ9Y247 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM50BQ9Y247 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAM50BQ9Y247 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM50BQ9Y247 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM50BQ9Y247 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAM50BQ9Y247 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAM50BQ9Y247 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM50BQ9Y247 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM50BQ9Y247 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAM50BQ9Y247 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM50BQ9Y247 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM50BQ9Y247 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAM50BQ9Y247 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FAM50BQ9Y247 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FAM50BQ9Y247 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FAM50BQ9Y247 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM50BQ9Y247 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM50BQ9Y247 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM50BQ9Y247 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM50BQ9Y247 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM50BQ9Y247 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM50BQ9Y247 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM50BQ9Y247 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM50BQ9Y247 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM50BQ9Y247 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM50BQ9Y247 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM50BQ9Y247 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM50BQ9Y247 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM50BQ9Y247 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms