Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPC6Q9Y210 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPC6Q9Y210 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRPC6Q9Y210 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRPC6Q9Y210 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRPC6Q9Y210 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRPC6Q9Y210 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRPC6Q9Y210 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRPC6Q9Y210 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRPC6Q9Y210 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRPC6Q9Y210 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRPC6Q9Y210 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRPC6Q9Y210 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TRPC6Q9Y210 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRPC6Q9Y210 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRPC6Q9Y210 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPC6Q9Y210 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPC6Q9Y210 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRPC6Q9Y210 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPC6Q9Y210 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPC6Q9Y210 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPC6Q9Y210 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRPC6Q9Y210 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TRPC6Q9Y210 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPC6Q9Y210 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPC6Q9Y210 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPC6Q9Y210 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRPC6Q9Y210 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRPC6Q9Y210 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRPC6Q9Y210 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRPC6Q9Y210 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRPC6Q9Y210 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRPC6Q9Y210 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRPC6Q9Y210 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRPC6Q9Y210 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRPC6Q9Y210 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRPC6Q9Y210 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRPC6Q9Y210 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRPC6Q9Y210 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRPC6Q9Y210 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRPC6Q9Y210 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRPC6Q9Y210 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRPC6Q9Y210 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRPC6Q9Y210 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRPC6Q9Y210 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRPC6Q9Y210 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRPC6Q9Y210 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRPC6Q9Y210 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRPC6Q9Y210 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRPC6Q9Y210 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRPC6Q9Y210 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRPC6Q9Y210 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRPC6Q9Y210 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRPC6Q9Y210 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRPC6Q9Y210 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRPC6Q9Y210 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRPC6Q9Y210 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRPC6Q9Y210 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRPC6Q9Y210 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRPC6Q9Y210 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRPC6Q9Y210 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRPC6Q9Y210 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TRPC6Q9Y210 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRPC6Q9Y210 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TRPC6Q9Y210 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRPC6Q9Y210 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRPC6Q9Y210 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRPC6Q9Y210 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms