Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
SHANK2Q9UPX8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
SHANK2Q9UPX8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
SHANK2Q9UPX8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
SHANK2Q9UPX8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
SHANK2Q9UPX8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
SHANK2Q9UPX8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
SHANK2Q9UPX8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
SHANK2Q9UPX8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
SHANK2Q9UPX8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
SHANK2Q9UPX8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
SHANK2Q9UPX8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
SHANK2Q9UPX8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
SHANK2Q9UPX8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
SHANK2Q9UPX8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
SHANK2Q9UPX8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
SHANK2Q9UPX8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
SHANK2Q9UPX8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
SHANK2Q9UPX8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
SHANK2Q9UPX8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
SHANK2Q9UPX8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SHANK2Q9UPX8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
SHANK2Q9UPX8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
SHANK2Q9UPX8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
SHANK2Q9UPX8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
SHANK2Q9UPX8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
SHANK2Q9UPX8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
SHANK2Q9UPX8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
SHANK2Q9UPX8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SHANK2Q9UPX8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
SHANK2Q9UPX8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
SHANK2Q9UPX8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
SHANK2Q9UPX8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
SHANK2Q9UPX8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
SHANK2Q9UPX8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
SHANK2Q9UPX8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SHANK2Q9UPX8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SHANK2Q9UPX8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SHANK2Q9UPX8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SHANK2Q9UPX8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SHANK2Q9UPX8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SHANK2Q9UPX8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SHANK2Q9UPX8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
SHANK2Q9UPX8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SHANK2Q9UPX8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SHANK2Q9UPX8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SHANK2Q9UPX8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SHANK2Q9UPX8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
SHANK2Q9UPX8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
SHANK2Q9UPX8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
SHANK2Q9UPX8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
SHANK2Q9UPX8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
SHANK2Q9UPX8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
SHANK2Q9UPX8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
SHANK2Q9UPX8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
SHANK2Q9UPX8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SHANK2Q9UPX8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
SHANK2Q9UPX8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
SHANK2Q9UPX8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
SHANK2Q9UPX8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
SHANK2Q9UPX8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
SHANK2Q9UPX8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
SHANK2Q9UPX8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
SHANK2Q9UPX8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
SHANK2Q9UPX8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
SHANK2Q9UPX8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
SHANK2Q9UPX8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.12■■■■□ 3.85
SHANK2Q9UPX8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SHANK2Q9UPX8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SHANK2Q9UPX8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SHANK2Q9UPX8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SHANK2Q9UPX8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SHANK2Q9UPX8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
SHANK2Q9UPX8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SHANK2Q9UPX8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SHANK2Q9UPX8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SHANK2Q9UPX8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
SHANK2Q9UPX8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
SHANK2Q9UPX8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC39.05■■■■□ 3.84
SHANK2Q9UPX8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
SHANK2Q9UPX8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
SHANK2Q9UPX8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
SHANK2Q9UPX8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SHANK2Q9UPX8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SHANK2Q9UPX8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
SHANK2Q9UPX8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SHANK2Q9UPX8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
SHANK2Q9UPX8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SHANK2Q9UPX8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SHANK2Q9UPX8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.98■■■■□ 3.83
SHANK2Q9UPX8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
SHANK2Q9UPX8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
SHANK2Q9UPX8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
SHANK2Q9UPX8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
SHANK2Q9UPX8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
SHANK2Q9UPX8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
SHANK2Q9UPX8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SHANK2Q9UPX8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SHANK2Q9UPX8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms