Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SORCS3Q9UPU3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SORCS3Q9UPU3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SORCS3Q9UPU3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SORCS3Q9UPU3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SORCS3Q9UPU3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SORCS3Q9UPU3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SORCS3Q9UPU3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SORCS3Q9UPU3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SORCS3Q9UPU3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SORCS3Q9UPU3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SORCS3Q9UPU3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SORCS3Q9UPU3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SORCS3Q9UPU3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SORCS3Q9UPU3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SORCS3Q9UPU3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SORCS3Q9UPU3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SORCS3Q9UPU3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SORCS3Q9UPU3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SORCS3Q9UPU3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SORCS3Q9UPU3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SORCS3Q9UPU3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SORCS3Q9UPU3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SORCS3Q9UPU3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SORCS3Q9UPU3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SORCS3Q9UPU3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SORCS3Q9UPU3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SORCS3Q9UPU3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SORCS3Q9UPU3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SORCS3Q9UPU3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SORCS3Q9UPU3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SORCS3Q9UPU3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SORCS3Q9UPU3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SORCS3Q9UPU3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SORCS3Q9UPU3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SORCS3Q9UPU3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SORCS3Q9UPU3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SORCS3Q9UPU3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SORCS3Q9UPU3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SORCS3Q9UPU3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SORCS3Q9UPU3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SORCS3Q9UPU3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SORCS3Q9UPU3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SORCS3Q9UPU3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SORCS3Q9UPU3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SORCS3Q9UPU3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SORCS3Q9UPU3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SORCS3Q9UPU3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SORCS3Q9UPU3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SORCS3Q9UPU3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SORCS3Q9UPU3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SORCS3Q9UPU3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SORCS3Q9UPU3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SORCS3Q9UPU3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SORCS3Q9UPU3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SORCS3Q9UPU3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SORCS3Q9UPU3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SORCS3Q9UPU3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SORCS3Q9UPU3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SORCS3Q9UPU3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SORCS3Q9UPU3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SORCS3Q9UPU3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SORCS3Q9UPU3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SORCS3Q9UPU3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SORCS3Q9UPU3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SORCS3Q9UPU3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SORCS3Q9UPU3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SORCS3Q9UPU3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SORCS3Q9UPU3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SORCS3Q9UPU3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SORCS3Q9UPU3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SORCS3Q9UPU3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SORCS3Q9UPU3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SORCS3Q9UPU3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SORCS3Q9UPU3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SORCS3Q9UPU3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SORCS3Q9UPU3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SORCS3Q9UPU3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SORCS3Q9UPU3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SORCS3Q9UPU3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SORCS3Q9UPU3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SORCS3Q9UPU3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SORCS3Q9UPU3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SORCS3Q9UPU3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SORCS3Q9UPU3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SORCS3Q9UPU3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SORCS3Q9UPU3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SORCS3Q9UPU3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SORCS3Q9UPU3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SORCS3Q9UPU3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SORCS3Q9UPU3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SORCS3Q9UPU3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SORCS3Q9UPU3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SORCS3Q9UPU3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SORCS3Q9UPU3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SORCS3Q9UPU3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SORCS3Q9UPU3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SORCS3Q9UPU3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SORCS3Q9UPU3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms