Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4AQ9UMR7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4AQ9UMR7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4AQ9UMR7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLEC4AQ9UMR7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC4AQ9UMR7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC4AQ9UMR7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC4AQ9UMR7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLEC4AQ9UMR7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLEC4AQ9UMR7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLEC4AQ9UMR7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLEC4AQ9UMR7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLEC4AQ9UMR7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLEC4AQ9UMR7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLEC4AQ9UMR7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC4AQ9UMR7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC4AQ9UMR7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC4AQ9UMR7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC4AQ9UMR7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4AQ9UMR7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4AQ9UMR7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4AQ9UMR7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC4AQ9UMR7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4AQ9UMR7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4AQ9UMR7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC4AQ9UMR7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4AQ9UMR7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4AQ9UMR7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4AQ9UMR7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4AQ9UMR7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4AQ9UMR7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC4AQ9UMR7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLEC4AQ9UMR7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC4AQ9UMR7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLEC4AQ9UMR7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLEC4AQ9UMR7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC4AQ9UMR7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC4AQ9UMR7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC4AQ9UMR7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC4AQ9UMR7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC4AQ9UMR7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC4AQ9UMR7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLEC4AQ9UMR7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLEC4AQ9UMR7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLEC4AQ9UMR7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLEC4AQ9UMR7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLEC4AQ9UMR7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLEC4AQ9UMR7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLEC4AQ9UMR7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLEC4AQ9UMR7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC4AQ9UMR7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC4AQ9UMR7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC4AQ9UMR7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms