Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NRXN1Q9ULB1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
NRXN1Q9ULB1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NRXN1Q9ULB1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NRXN1Q9ULB1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NRXN1Q9ULB1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NRXN1Q9ULB1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NRXN1Q9ULB1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NRXN1Q9ULB1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NRXN1Q9ULB1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NRXN1Q9ULB1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NRXN1Q9ULB1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NRXN1Q9ULB1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NRXN1Q9ULB1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NRXN1Q9ULB1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NRXN1Q9ULB1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NRXN1Q9ULB1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NRXN1Q9ULB1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NRXN1Q9ULB1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NRXN1Q9ULB1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NRXN1Q9ULB1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NRXN1Q9ULB1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NRXN1Q9ULB1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NRXN1Q9ULB1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NRXN1Q9ULB1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NRXN1Q9ULB1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
NRXN1Q9ULB1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NRXN1Q9ULB1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NRXN1Q9ULB1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
NRXN1Q9ULB1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
NRXN1Q9ULB1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NRXN1Q9ULB1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NRXN1Q9ULB1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NRXN1Q9ULB1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NRXN1Q9ULB1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NRXN1Q9ULB1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NRXN1Q9ULB1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
NRXN1Q9ULB1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
NRXN1Q9ULB1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NRXN1Q9ULB1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
NRXN1Q9ULB1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NRXN1Q9ULB1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NRXN1Q9ULB1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NRXN1Q9ULB1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NRXN1Q9ULB1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NRXN1Q9ULB1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NRXN1Q9ULB1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
NRXN1Q9ULB1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NRXN1Q9ULB1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NRXN1Q9ULB1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
NRXN1Q9ULB1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.52
NRXN1Q9ULB1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
NRXN1Q9ULB1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NRXN1Q9ULB1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NRXN1Q9ULB1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NRXN1Q9ULB1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NRXN1Q9ULB1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
NRXN1Q9ULB1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NRXN1Q9ULB1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NRXN1Q9ULB1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NRXN1Q9ULB1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NRXN1Q9ULB1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NRXN1Q9ULB1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
NRXN1Q9ULB1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
NRXN1Q9ULB1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
NRXN1Q9ULB1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
NRXN1Q9ULB1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
NRXN1Q9ULB1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
NRXN1Q9ULB1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
NRXN1Q9ULB1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
NRXN1Q9ULB1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
NRXN1Q9ULB1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
NRXN1Q9ULB1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NRXN1Q9ULB1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NRXN1Q9ULB1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
NRXN1Q9ULB1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NRXN1Q9ULB1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NRXN1Q9ULB1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NRXN1Q9ULB1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NRXN1Q9ULB1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NRXN1Q9ULB1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NRXN1Q9ULB1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NRXN1Q9ULB1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NRXN1Q9ULB1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NRXN1Q9ULB1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NRXN1Q9ULB1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NRXN1Q9ULB1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NRXN1Q9ULB1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NRXN1Q9ULB1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NRXN1Q9ULB1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NRXN1Q9ULB1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NRXN1Q9ULB1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.5
NRXN1Q9ULB1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NRXN1Q9ULB1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NRXN1Q9ULB1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NRXN1Q9ULB1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NRXN1Q9ULB1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NRXN1Q9ULB1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NRXN1Q9ULB1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NRXN1Q9ULB1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms