Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RABGEF1Q9UJ41 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RABGEF1Q9UJ41 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RABGEF1Q9UJ41 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RABGEF1Q9UJ41 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RABGEF1Q9UJ41 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RABGEF1Q9UJ41 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABGEF1Q9UJ41 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RABGEF1Q9UJ41 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RABGEF1Q9UJ41 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RABGEF1Q9UJ41 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABGEF1Q9UJ41 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABGEF1Q9UJ41 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABGEF1Q9UJ41 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RABGEF1Q9UJ41 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGEF1Q9UJ41 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGEF1Q9UJ41 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RABGEF1Q9UJ41 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABGEF1Q9UJ41 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RABGEF1Q9UJ41 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RABGEF1Q9UJ41 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RABGEF1Q9UJ41 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGEF1Q9UJ41 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RABGEF1Q9UJ41 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGEF1Q9UJ41 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RABGEF1Q9UJ41 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABGEF1Q9UJ41 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RABGEF1Q9UJ41 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABGEF1Q9UJ41 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABGEF1Q9UJ41 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RABGEF1Q9UJ41 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RABGEF1Q9UJ41 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RABGEF1Q9UJ41 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABGEF1Q9UJ41 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABGEF1Q9UJ41 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RABGEF1Q9UJ41 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RABGEF1Q9UJ41 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RABGEF1Q9UJ41 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RABGEF1Q9UJ41 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RABGEF1Q9UJ41 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RABGEF1Q9UJ41 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RABGEF1Q9UJ41 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABGEF1Q9UJ41 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABGEF1Q9UJ41 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABGEF1Q9UJ41 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABGEF1Q9UJ41 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RABGEF1Q9UJ41 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RABGEF1Q9UJ41 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RABGEF1Q9UJ41 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RABGEF1Q9UJ41 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RABGEF1Q9UJ41 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RABGEF1Q9UJ41 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RABGEF1Q9UJ41 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RABGEF1Q9UJ41 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RABGEF1Q9UJ41 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RABGEF1Q9UJ41 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RABGEF1Q9UJ41 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RABGEF1Q9UJ41 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RABGEF1Q9UJ41 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RABGEF1Q9UJ41 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RABGEF1Q9UJ41 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RABGEF1Q9UJ41 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RABGEF1Q9UJ41 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RABGEF1Q9UJ41 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RABGEF1Q9UJ41 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RABGEF1Q9UJ41 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RABGEF1Q9UJ41 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RABGEF1Q9UJ41 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RABGEF1Q9UJ41 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RABGEF1Q9UJ41 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABGEF1Q9UJ41 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
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