Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SCN11AQ9UI33 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SCN11AQ9UI33 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCN11AQ9UI33 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCN11AQ9UI33 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SCN11AQ9UI33 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCN11AQ9UI33 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SCN11AQ9UI33 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCN11AQ9UI33 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SCN11AQ9UI33 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SCN11AQ9UI33 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SCN11AQ9UI33 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SCN11AQ9UI33 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SCN11AQ9UI33 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SCN11AQ9UI33 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCN11AQ9UI33 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SCN11AQ9UI33 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCN11AQ9UI33 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCN11AQ9UI33 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCN11AQ9UI33 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCN11AQ9UI33 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SCN11AQ9UI33 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SCN11AQ9UI33 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SCN11AQ9UI33 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SCN11AQ9UI33 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SCN11AQ9UI33 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SCN11AQ9UI33 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SCN11AQ9UI33 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SCN11AQ9UI33 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SCN11AQ9UI33 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SCN11AQ9UI33 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SCN11AQ9UI33 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SCN11AQ9UI33 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SCN11AQ9UI33 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SCN11AQ9UI33 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
SCN11AQ9UI33 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SCN11AQ9UI33 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SCN11AQ9UI33 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCN11AQ9UI33 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCN11AQ9UI33 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCN11AQ9UI33 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCN11AQ9UI33 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SCN11AQ9UI33 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SCN11AQ9UI33 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCN11AQ9UI33 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCN11AQ9UI33 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCN11AQ9UI33 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCN11AQ9UI33 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCN11AQ9UI33 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SCN11AQ9UI33 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SCN11AQ9UI33 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SCN11AQ9UI33 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SCN11AQ9UI33 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SCN11AQ9UI33 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SCN11AQ9UI33 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SCN11AQ9UI33 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SCN11AQ9UI33 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SCN11AQ9UI33 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SCN11AQ9UI33 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SCN11AQ9UI33 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SCN11AQ9UI33 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SCN11AQ9UI33 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SCN11AQ9UI33 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SCN11AQ9UI33 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
SCN11AQ9UI33 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SCN11AQ9UI33 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SCN11AQ9UI33 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SCN11AQ9UI33 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
SCN11AQ9UI33 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SCN11AQ9UI33 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCN11AQ9UI33 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCN11AQ9UI33 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCN11AQ9UI33 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCN11AQ9UI33 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SCN11AQ9UI33 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCN11AQ9UI33 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCN11AQ9UI33 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCN11AQ9UI33 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms