Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ6

SHPK, Sedoheptulokinase, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPKQ9UHJ6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHPKQ9UHJ6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHPKQ9UHJ6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHPKQ9UHJ6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHPKQ9UHJ6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPKQ9UHJ6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPKQ9UHJ6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPKQ9UHJ6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPKQ9UHJ6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHPKQ9UHJ6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPKQ9UHJ6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPKQ9UHJ6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHPKQ9UHJ6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHPKQ9UHJ6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHPKQ9UHJ6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHPKQ9UHJ6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHPKQ9UHJ6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHPKQ9UHJ6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHPKQ9UHJ6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHPKQ9UHJ6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHPKQ9UHJ6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHPKQ9UHJ6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms