Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
MLH3Q9UHC1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
MLH3Q9UHC1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
MLH3Q9UHC1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
MLH3Q9UHC1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
MLH3Q9UHC1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
MLH3Q9UHC1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
MLH3Q9UHC1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
MLH3Q9UHC1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
MLH3Q9UHC1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
MLH3Q9UHC1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
MLH3Q9UHC1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
MLH3Q9UHC1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
MLH3Q9UHC1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.94
MLH3Q9UHC1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
MLH3Q9UHC1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
MLH3Q9UHC1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC39.63■■■■□ 3.94
MLH3Q9UHC1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
MLH3Q9UHC1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
MLH3Q9UHC1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
MLH3Q9UHC1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
MLH3Q9UHC1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.62■■■■□ 3.93
MLH3Q9UHC1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
MLH3Q9UHC1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
MLH3Q9UHC1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
MLH3Q9UHC1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
MLH3Q9UHC1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
MLH3Q9UHC1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
MLH3Q9UHC1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
MLH3Q9UHC1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
MLH3Q9UHC1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.92
MLH3Q9UHC1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
MLH3Q9UHC1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
MLH3Q9UHC1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
MLH3Q9UHC1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
MLH3Q9UHC1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
MLH3Q9UHC1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
MLH3Q9UHC1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
MLH3Q9UHC1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
MLH3Q9UHC1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
MLH3Q9UHC1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
MLH3Q9UHC1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
MLH3Q9UHC1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
MLH3Q9UHC1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
MLH3Q9UHC1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
MLH3Q9UHC1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
MLH3Q9UHC1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
MLH3Q9UHC1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
MLH3Q9UHC1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
MLH3Q9UHC1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
MLH3Q9UHC1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
MLH3Q9UHC1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
MLH3Q9UHC1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
MLH3Q9UHC1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
MLH3Q9UHC1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
MLH3Q9UHC1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
MLH3Q9UHC1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
MLH3Q9UHC1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
MLH3Q9UHC1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
MLH3Q9UHC1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
MLH3Q9UHC1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
MLH3Q9UHC1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
MLH3Q9UHC1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
MLH3Q9UHC1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
MLH3Q9UHC1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
MLH3Q9UHC1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
MLH3Q9UHC1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
MLH3Q9UHC1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
MLH3Q9UHC1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
MLH3Q9UHC1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
MLH3Q9UHC1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
MLH3Q9UHC1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
MLH3Q9UHC1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
MLH3Q9UHC1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
MLH3Q9UHC1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
MLH3Q9UHC1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
MLH3Q9UHC1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
MLH3Q9UHC1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC39.3■■■■□ 3.88
MLH3Q9UHC1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
MLH3Q9UHC1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
MLH3Q9UHC1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
MLH3Q9UHC1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
MLH3Q9UHC1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
MLH3Q9UHC1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
MLH3Q9UHC1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
MLH3Q9UHC1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
MLH3Q9UHC1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
MLH3Q9UHC1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
MLH3Q9UHC1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
MLH3Q9UHC1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
MLH3Q9UHC1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
MLH3Q9UHC1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
MLH3Q9UHC1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
MLH3Q9UHC1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
MLH3Q9UHC1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
MLH3Q9UHC1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
MLH3Q9UHC1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
MLH3Q9UHC1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
MLH3Q9UHC1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
MLH3Q9UHC1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms