Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS29Q9UBQ0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS29Q9UBQ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS29Q9UBQ0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS29Q9UBQ0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS29Q9UBQ0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS29Q9UBQ0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS29Q9UBQ0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS29Q9UBQ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS29Q9UBQ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS29Q9UBQ0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS29Q9UBQ0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS29Q9UBQ0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS29Q9UBQ0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS29Q9UBQ0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS29Q9UBQ0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS29Q9UBQ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS29Q9UBQ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS29Q9UBQ0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms